Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbp4Q61107 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbp4Q61107 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp4Q61107 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp4Q61107 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp4Q61107 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp4Q61107 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp4Q61107 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp4Q61107 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbp4Q61107 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbp4Q61107 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbp4Q61107 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbp4Q61107 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbp4Q61107 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp4Q61107 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp4Q61107 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp4Q61107 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp4Q61107 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp4Q61107 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp4Q61107 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp4Q61107 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gbp4Q61107 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gbp4Q61107 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbp4Q61107 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms