Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Phf12Q5SPL2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Phf12Q5SPL2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Phf12Q5SPL2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Phf12Q5SPL2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Phf12Q5SPL2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Phf12Q5SPL2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Phf12Q5SPL2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Phf12Q5SPL2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms