Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scarf1Q5ND28 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Scarf1Q5ND28 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Scarf1Q5ND28 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Scarf1Q5ND28 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scarf1Q5ND28 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scarf1Q5ND28 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scarf1Q5ND28 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scarf1Q5ND28 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scarf1Q5ND28 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scarf1Q5ND28 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scarf1Q5ND28 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scarf1Q5ND28 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scarf1Q5ND28 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scarf1Q5ND28 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scarf1Q5ND28 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scarf1Q5ND28 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scarf1Q5ND28 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scarf1Q5ND28 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scarf1Q5ND28 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scarf1Q5ND28 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scarf1Q5ND28 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scarf1Q5ND28 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scarf1Q5ND28 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scarf1Q5ND28 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scarf1Q5ND28 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scarf1Q5ND28 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scarf1Q5ND28 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Scarf1Q5ND28 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scarf1Q5ND28 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scarf1Q5ND28 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Scarf1Q5ND28 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scarf1Q5ND28 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Scarf1Q5ND28 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scarf1Q5ND28 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Scarf1Q5ND28 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scarf1Q5ND28 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scarf1Q5ND28 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scarf1Q5ND28 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scarf1Q5ND28 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scarf1Q5ND28 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scarf1Q5ND28 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scarf1Q5ND28 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scarf1Q5ND28 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scarf1Q5ND28 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scarf1Q5ND28 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scarf1Q5ND28 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scarf1Q5ND28 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scarf1Q5ND28 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms