Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930596D02RikQ3V0H9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930596D02RikQ3V0H9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms