Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc27Q3V036 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc27Q3V036 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc27Q3V036 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc27Q3V036 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc27Q3V036 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc27Q3V036 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc27Q3V036 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc27Q3V036 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc27Q3V036 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc27Q3V036 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc27Q3V036 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc27Q3V036 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc27Q3V036 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc27Q3V036 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc27Q3V036 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc27Q3V036 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc27Q3V036 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc27Q3V036 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc27Q3V036 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc27Q3V036 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc27Q3V036 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc27Q3V036 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc27Q3V036 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc27Q3V036 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc27Q3V036 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc27Q3V036 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc27Q3V036 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc27Q3V036 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc27Q3V036 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc27Q3V036 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc27Q3V036 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc27Q3V036 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc27Q3V036 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc27Q3V036 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc27Q3V036 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc27Q3V036 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc27Q3V036 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc27Q3V036 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc27Q3V036 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc27Q3V036 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc27Q3V036 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc27Q3V036 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc27Q3V036 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc27Q3V036 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc27Q3V036 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc27Q3V036 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc27Q3V036 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc27Q3V036 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc27Q3V036 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc27Q3V036 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc27Q3V036 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc27Q3V036 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc27Q3V036 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc27Q3V036 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc27Q3V036 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc27Q3V036 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc27Q3V036 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc27Q3V036 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc27Q3V036 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc27Q3V036 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc27Q3V036 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc27Q3V036 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc27Q3V036 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc27Q3V036 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc27Q3V036 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc27Q3V036 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc27Q3V036 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc27Q3V036 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc27Q3V036 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc27Q3V036 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc27Q3V036 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc27Q3V036 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc27Q3V036 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc27Q3V036 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc27Q3V036 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc27Q3V036 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc27Q3V036 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc27Q3V036 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc27Q3V036 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc27Q3V036 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc27Q3V036 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc27Q3V036 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc27Q3V036 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc27Q3V036 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc27Q3V036 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc27Q3V036 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc27Q3V036 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc27Q3V036 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc27Q3V036 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc27Q3V036 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc27Q3V036 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc27Q3V036 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc27Q3V036 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc27Q3V036 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc27Q3V036 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc27Q3V036 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc27Q3V036 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc27Q3V036 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc27Q3V036 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.7 ms