Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTW2

A530084C06Rik, RIKEN cDNA A530084C06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A530084C06RikQ3UTW2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
A530084C06RikQ3UTW2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
A530084C06RikQ3UTW2 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A530084C06RikQ3UTW2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
A530084C06RikQ3UTW2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
A530084C06RikQ3UTW2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms