Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Smim15Q3UTD9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim15Q3UTD9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim15Q3UTD9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms