Protein–RNA interactions for Protein: Q3USY0

Slc38a11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a11Q3USY0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc38a11Q3USY0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc38a11Q3USY0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc38a11Q3USY0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Slc38a11Q3USY0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc38a11Q3USY0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc38a11Q3USY0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc38a11Q3USY0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc38a11Q3USY0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc38a11Q3USY0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc38a11Q3USY0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc38a11Q3USY0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc38a11Q3USY0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc38a11Q3USY0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc38a11Q3USY0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Slc38a11Q3USY0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc38a11Q3USY0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc38a11Q3USY0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc38a11Q3USY0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc38a11Q3USY0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc38a11Q3USY0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc38a11Q3USY0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc38a11Q3USY0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc38a11Q3USY0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc38a11Q3USY0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc38a11Q3USY0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Slc38a11Q3USY0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc38a11Q3USY0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc38a11Q3USY0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc38a11Q3USY0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc38a11Q3USY0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc38a11Q3USY0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Slc38a11Q3USY0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc38a11Q3USY0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Slc38a11Q3USY0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc38a11Q3USY0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc38a11Q3USY0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc38a11Q3USY0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc38a11Q3USY0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc38a11Q3USY0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Slc38a11Q3USY0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc38a11Q3USY0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc38a11Q3USY0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc38a11Q3USY0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc38a11Q3USY0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc38a11Q3USY0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc38a11Q3USY0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc38a11Q3USY0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc38a11Q3USY0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc38a11Q3USY0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc38a11Q3USY0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc38a11Q3USY0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc38a11Q3USY0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc38a11Q3USY0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms