Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Mccc2Q3ULD5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mccc2Q3ULD5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mccc2Q3ULD5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms