Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDP0

Wdr41, WD repeat-containing protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr41Q3UDP0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Wdr41Q3UDP0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Wdr41Q3UDP0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Wdr41Q3UDP0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wdr41Q3UDP0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wdr41Q3UDP0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wdr41Q3UDP0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wdr41Q3UDP0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wdr41Q3UDP0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wdr41Q3UDP0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wdr41Q3UDP0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Wdr41Q3UDP0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Wdr41Q3UDP0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Wdr41Q3UDP0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Wdr41Q3UDP0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Wdr41Q3UDP0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Wdr41Q3UDP0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Wdr41Q3UDP0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Wdr41Q3UDP0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Wdr41Q3UDP0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Wdr41Q3UDP0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Wdr41Q3UDP0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Wdr41Q3UDP0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Wdr41Q3UDP0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wdr41Q3UDP0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wdr41Q3UDP0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wdr41Q3UDP0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Wdr41Q3UDP0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Wdr41Q3UDP0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Wdr41Q3UDP0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Wdr41Q3UDP0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Wdr41Q3UDP0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Wdr41Q3UDP0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Wdr41Q3UDP0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Wdr41Q3UDP0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Wdr41Q3UDP0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Wdr41Q3UDP0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Wdr41Q3UDP0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Wdr41Q3UDP0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Wdr41Q3UDP0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Wdr41Q3UDP0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Wdr41Q3UDP0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Wdr41Q3UDP0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Wdr41Q3UDP0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Wdr41Q3UDP0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Wdr41Q3UDP0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Wdr41Q3UDP0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Wdr41Q3UDP0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Wdr41Q3UDP0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wdr41Q3UDP0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wdr41Q3UDP0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wdr41Q3UDP0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wdr41Q3UDP0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Wdr41Q3UDP0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr41Q3UDP0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr41Q3UDP0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr41Q3UDP0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr41Q3UDP0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Wdr41Q3UDP0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms