Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

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Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec24aQ3U2P1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec24aQ3U2P1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec24aQ3U2P1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec24aQ3U2P1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec24aQ3U2P1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec24aQ3U2P1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec24aQ3U2P1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec24aQ3U2P1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec24aQ3U2P1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec24aQ3U2P1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec24aQ3U2P1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec24aQ3U2P1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec24aQ3U2P1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec24aQ3U2P1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec24aQ3U2P1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec24aQ3U2P1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec24aQ3U2P1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec24aQ3U2P1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec24aQ3U2P1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec24aQ3U2P1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec24aQ3U2P1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec24aQ3U2P1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec24aQ3U2P1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec24aQ3U2P1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec24aQ3U2P1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec24aQ3U2P1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec24aQ3U2P1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec24aQ3U2P1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec24aQ3U2P1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec24aQ3U2P1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sec24aQ3U2P1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sec24aQ3U2P1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sec24aQ3U2P1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sec24aQ3U2P1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sec24aQ3U2P1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sec24aQ3U2P1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec24aQ3U2P1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec24aQ3U2P1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec24aQ3U2P1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec24aQ3U2P1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec24aQ3U2P1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec24aQ3U2P1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec24aQ3U2P1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec24aQ3U2P1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec24aQ3U2P1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec24aQ3U2P1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sec24aQ3U2P1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec24aQ3U2P1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sec24aQ3U2P1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec24aQ3U2P1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec24aQ3U2P1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec24aQ3U2P1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec24aQ3U2P1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sec24aQ3U2P1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sec24aQ3U2P1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sec24aQ3U2P1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sec24aQ3U2P1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sec24aQ3U2P1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sec24aQ3U2P1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sec24aQ3U2P1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sec24aQ3U2P1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sec24aQ3U2P1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sec24aQ3U2P1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sec24aQ3U2P1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sec24aQ3U2P1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sec24aQ3U2P1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sec24aQ3U2P1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sec24aQ3U2P1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sec24aQ3U2P1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sec24aQ3U2P1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sec24aQ3U2P1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Sec24aQ3U2P1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sec24aQ3U2P1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec24aQ3U2P1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec24aQ3U2P1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec24aQ3U2P1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec24aQ3U2P1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec24aQ3U2P1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec24aQ3U2P1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec24aQ3U2P1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec24aQ3U2P1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec24aQ3U2P1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sec24aQ3U2P1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec24aQ3U2P1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec24aQ3U2P1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec24aQ3U2P1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec24aQ3U2P1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec24aQ3U2P1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec24aQ3U2P1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec24aQ3U2P1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec24aQ3U2P1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec24aQ3U2P1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec24aQ3U2P1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sec24aQ3U2P1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sec24aQ3U2P1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sec24aQ3U2P1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sec24aQ3U2P1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sec24aQ3U2P1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sec24aQ3U2P1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms