Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TraddQ3U0V2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TraddQ3U0V2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TraddQ3U0V2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TraddQ3U0V2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TraddQ3U0V2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TraddQ3U0V2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TraddQ3U0V2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TraddQ3U0V2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TraddQ3U0V2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TraddQ3U0V2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TraddQ3U0V2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TraddQ3U0V2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TraddQ3U0V2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TraddQ3U0V2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TraddQ3U0V2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TraddQ3U0V2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TraddQ3U0V2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TraddQ3U0V2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TraddQ3U0V2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TraddQ3U0V2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TraddQ3U0V2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TraddQ3U0V2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TraddQ3U0V2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TraddQ3U0V2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TraddQ3U0V2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TraddQ3U0V2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TraddQ3U0V2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TraddQ3U0V2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TraddQ3U0V2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TraddQ3U0V2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TraddQ3U0V2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TraddQ3U0V2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TraddQ3U0V2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TraddQ3U0V2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TraddQ3U0V2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TraddQ3U0V2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TraddQ3U0V2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TraddQ3U0V2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TraddQ3U0V2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TraddQ3U0V2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TraddQ3U0V2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TraddQ3U0V2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TraddQ3U0V2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TraddQ3U0V2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TraddQ3U0V2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TraddQ3U0V2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TraddQ3U0V2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TraddQ3U0V2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TraddQ3U0V2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TraddQ3U0V2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TraddQ3U0V2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TraddQ3U0V2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TraddQ3U0V2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TraddQ3U0V2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TraddQ3U0V2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TraddQ3U0V2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TraddQ3U0V2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TraddQ3U0V2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TraddQ3U0V2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TraddQ3U0V2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TraddQ3U0V2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TraddQ3U0V2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TraddQ3U0V2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TraddQ3U0V2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TraddQ3U0V2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TraddQ3U0V2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TraddQ3U0V2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TraddQ3U0V2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TraddQ3U0V2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TraddQ3U0V2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TraddQ3U0V2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TraddQ3U0V2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TraddQ3U0V2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TraddQ3U0V2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TraddQ3U0V2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TraddQ3U0V2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TraddQ3U0V2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TraddQ3U0V2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TraddQ3U0V2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
TraddQ3U0V2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TraddQ3U0V2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TraddQ3U0V2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TraddQ3U0V2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TraddQ3U0V2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TraddQ3U0V2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TraddQ3U0V2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TraddQ3U0V2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TraddQ3U0V2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TraddQ3U0V2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TraddQ3U0V2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TraddQ3U0V2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TraddQ3U0V2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TraddQ3U0V2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TraddQ3U0V2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TraddQ3U0V2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TraddQ3U0V2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TraddQ3U0V2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TraddQ3U0V2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TraddQ3U0V2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms