Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NeblQ0II04 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NeblQ0II04 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NeblQ0II04 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NeblQ0II04 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NeblQ0II04 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NeblQ0II04 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NeblQ0II04 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NeblQ0II04 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NeblQ0II04 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NeblQ0II04 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NeblQ0II04 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NeblQ0II04 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NeblQ0II04 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NeblQ0II04 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NeblQ0II04 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NeblQ0II04 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NeblQ0II04 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NeblQ0II04 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NeblQ0II04 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NeblQ0II04 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NeblQ0II04 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NeblQ0II04 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NeblQ0II04 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NeblQ0II04 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NeblQ0II04 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NeblQ0II04 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NeblQ0II04 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NeblQ0II04 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NeblQ0II04 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NeblQ0II04 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NeblQ0II04 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NeblQ0II04 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NeblQ0II04 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NeblQ0II04 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NeblQ0II04 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NeblQ0II04 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NeblQ0II04 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NeblQ0II04 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NeblQ0II04 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NeblQ0II04 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NeblQ0II04 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NeblQ0II04 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NeblQ0II04 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NeblQ0II04 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NeblQ0II04 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NeblQ0II04 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NeblQ0II04 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NeblQ0II04 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NeblQ0II04 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NeblQ0II04 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NeblQ0II04 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NeblQ0II04 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NeblQ0II04 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NeblQ0II04 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NeblQ0II04 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NeblQ0II04 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NeblQ0II04 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms