Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Crisp3Q03402 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Crisp3Q03402 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Crisp3Q03402 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms