Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apoa1Q00623 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apoa1Q00623 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apoa1Q00623 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms