Protein–RNA interactions for Protein: P62915

Gtf2b, Transcription initiation factor IIB, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2bP62915 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2bP62915 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2bP62915 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2bP62915 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2bP62915 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2bP62915 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2bP62915 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2bP62915 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2bP62915 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2bP62915 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2bP62915 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2bP62915 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2bP62915 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2bP62915 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2bP62915 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2bP62915 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2bP62915 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2bP62915 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2bP62915 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2bP62915 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2bP62915 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2bP62915 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2bP62915 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2bP62915 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2bP62915 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2bP62915 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2bP62915 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2bP62915 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2bP62915 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2bP62915 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2bP62915 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2bP62915 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2bP62915 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2bP62915 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gtf2bP62915 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2bP62915 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2bP62915 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2bP62915 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2bP62915 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2bP62915 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2bP62915 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2bP62915 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2bP62915 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2bP62915 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2bP62915 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2bP62915 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2bP62915 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2bP62915 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2bP62915 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2bP62915 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2bP62915 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2bP62915 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2bP62915 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2bP62915 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms