Protein–RNA interactions for Protein: P61967

Ap1s1, AP-1 complex subunit sigma-1A, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s1P61967 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap1s1P61967 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ap1s1P61967 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ap1s1P61967 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap1s1P61967 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap1s1P61967 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap1s1P61967 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap1s1P61967 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap1s1P61967 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap1s1P61967 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap1s1P61967 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap1s1P61967 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap1s1P61967 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap1s1P61967 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap1s1P61967 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap1s1P61967 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap1s1P61967 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap1s1P61967 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap1s1P61967 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap1s1P61967 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ap1s1P61967 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ap1s1P61967 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms