Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga11P61622 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga11P61622 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga11P61622 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga11P61622 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga11P61622 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga11P61622 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Itga11P61622 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga11P61622 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga11P61622 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga11P61622 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga11P61622 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga11P61622 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga11P61622 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga11P61622 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga11P61622 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga11P61622 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga11P61622 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga11P61622 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga11P61622 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga11P61622 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga11P61622 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga11P61622 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga11P61622 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga11P61622 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga11P61622 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga11P61622 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga11P61622 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga11P61622 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga11P61622 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga11P61622 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga11P61622 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga11P61622 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga11P61622 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga11P61622 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga11P61622 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga11P61622 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga11P61622 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga11P61622 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga11P61622 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga11P61622 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Itga11P61622 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Itga11P61622 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga11P61622 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga11P61622 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga11P61622 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga11P61622 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga11P61622 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga11P61622 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms