Protein–RNA interactions for Protein: P56203

Ctsw, Cathepsin W, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtswP56203 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtswP56203 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtswP56203 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtswP56203 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CtswP56203 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtswP56203 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtswP56203 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtswP56203 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtswP56203 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtswP56203 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtswP56203 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CtswP56203 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtswP56203 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtswP56203 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtswP56203 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtswP56203 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtswP56203 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtswP56203 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CtswP56203 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtswP56203 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtswP56203 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtswP56203 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CtswP56203 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtswP56203 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CtswP56203 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtswP56203 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtswP56203 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtswP56203 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtswP56203 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtswP56203 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtswP56203 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CtswP56203 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtswP56203 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtswP56203 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtswP56203 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtswP56203 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtswP56203 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtswP56203 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CtswP56203 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtswP56203 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtswP56203 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtswP56203 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtswP56203 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtswP56203 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CtswP56203 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CtswP56203 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtswP56203 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtswP56203 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtswP56203 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtswP56203 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtswP56203 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CtswP56203 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtswP56203 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtswP56203 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtswP56203 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtswP56203 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtswP56203 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtswP56203 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtswP56203 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtswP56203 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtswP56203 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CtswP56203 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CtswP56203 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CtswP56203 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CtswP56203 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CtswP56203 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtswP56203 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtswP56203 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtswP56203 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtswP56203 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtswP56203 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtswP56203 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtswP56203 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtswP56203 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtswP56203 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtswP56203 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtswP56203 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CtswP56203 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CtswP56203 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CtswP56203 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CtswP56203 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CtswP56203 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CtswP56203 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CtswP56203 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CtswP56203 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CtswP56203 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CtswP56203 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CtswP56203 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CtswP56203 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CtswP56203 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CtswP56203 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CtswP56203 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CtswP56203 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtswP56203 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtswP56203 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtswP56203 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtswP56203 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtswP56203 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtswP56203 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtswP56203 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms