Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fgd1P52734 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fgd1P52734 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Fgd1P52734 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Fgd1P52734 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fgd1P52734 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fgd1P52734 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fgd1P52734 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fgd1P52734 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Fgd1P52734 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fgd1P52734 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fgd1P52734 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fgd1P52734 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fgd1P52734 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fgd1P52734 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fgd1P52734 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fgd1P52734 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fgd1P52734 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fgd1P52734 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fgd1P52734 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fgd1P52734 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fgd1P52734 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fgd1P52734 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fgd1P52734 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fgd1P52734 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fgd1P52734 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fgd1P52734 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fgd1P52734 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fgd1P52734 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fgd1P52734 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fgd1P52734 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fgd1P52734 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fgd1P52734 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fgd1P52734 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fgd1P52734 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fgd1P52734 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fgd1P52734 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Fgd1P52734 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Fgd1P52734 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fgd1P52734 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fgd1P52734 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fgd1P52734 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fgd1P52734 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fgd1P52734 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fgd1P52734 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fgd1P52734 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fgd1P52734 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fgd1P52734 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fgd1P52734 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fgd1P52734 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fgd1P52734 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fgd1P52734 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fgd1P52734 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fgd1P52734 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Fgd1P52734 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fgd1P52734 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fgd1P52734 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fgd1P52734 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fgd1P52734 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fgd1P52734 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fgd1P52734 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fgd1P52734 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fgd1P52734 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fgd1P52734 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fgd1P52734 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fgd1P52734 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fgd1P52734 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fgd1P52734 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fgd1P52734 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fgd1P52734 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Fgd1P52734 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Fgd1P52734 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fgd1P52734 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fgd1P52734 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fgd1P52734 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fgd1P52734 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fgd1P52734 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fgd1P52734 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fgd1P52734 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fgd1P52734 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fgd1P52734 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fgd1P52734 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Fgd1P52734 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fgd1P52734 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fgd1P52734 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fgd1P52734 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fgd1P52734 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fgd1P52734 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fgd1P52734 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fgd1P52734 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fgd1P52734 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fgd1P52734 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fgd1P52734 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fgd1P52734 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fgd1P52734 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fgd1P52734 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fgd1P52734 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fgd1P52734 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fgd1P52734 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Fgd1P52734 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms