Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa11P50709 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa11P50709 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa11P50709 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa11P50709 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa11P50709 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa11P50709 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa11P50709 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa11P50709 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms