Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa11P50709 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa11P50709 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa11P50709 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa11P50709 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa11P50709 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa11P50709 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa11P50709 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Defa11P50709 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa11P50709 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa11P50709 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Defa11P50709 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.4 ms