Protein–RNA interactions for Protein: P46718

Pdcd2, Programmed cell death protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd2P46718 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdcd2P46718 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pdcd2P46718 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pdcd2P46718 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdcd2P46718 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdcd2P46718 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms