Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx2-5P42582 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx2-5P42582 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx2-5P42582 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx2-5P42582 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nkx2-5P42582 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx2-5P42582 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx2-5P42582 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx2-5P42582 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx2-5P42582 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx2-5P42582 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx2-5P42582 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx2-5P42582 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx2-5P42582 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx2-5P42582 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx2-5P42582 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx2-5P42582 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx2-5P42582 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx2-5P42582 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx2-5P42582 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx2-5P42582 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx2-5P42582 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx2-5P42582 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx2-5P42582 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx2-5P42582 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nkx2-5P42582 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nkx2-5P42582 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nkx2-5P42582 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nkx2-5P42582 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx2-5P42582 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx2-5P42582 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx2-5P42582 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx2-5P42582 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx2-5P42582 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx2-5P42582 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx2-5P42582 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx2-5P42582 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx2-5P42582 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx2-5P42582 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx2-5P42582 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx2-5P42582 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx2-5P42582 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx2-5P42582 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx2-5P42582 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx2-5P42582 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkx2-5P42582 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkx2-5P42582 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx2-5P42582 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx2-5P42582 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx2-5P42582 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx2-5P42582 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx2-5P42582 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx2-5P42582 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx2-5P42582 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx2-5P42582 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx2-5P42582 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx2-5P42582 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms