Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Rpl28P41105 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rpl28P41105 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Rpl28P41105 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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