Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NapbP28663 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NapbP28663 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NapbP28663 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NapbP28663 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NapbP28663 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NapbP28663 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NapbP28663 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NapbP28663 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NapbP28663 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NapbP28663 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NapbP28663 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NapbP28663 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NapbP28663 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NapbP28663 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NapbP28663 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NapbP28663 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NapbP28663 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NapbP28663 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NapbP28663 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NapbP28663 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NapbP28663 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NapbP28663 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NapbP28663 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NapbP28663 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NapbP28663 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NapbP28663 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NapbP28663 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NapbP28663 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NapbP28663 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NapbP28663 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NapbP28663 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NapbP28663 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NapbP28663 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NapbP28663 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NapbP28663 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NapbP28663 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NapbP28663 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NapbP28663 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NapbP28663 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NapbP28663 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NapbP28663 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NapbP28663 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NapbP28663 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NapbP28663 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NapbP28663 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NapbP28663 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NapbP28663 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NapbP28663 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NapbP28663 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NapbP28663 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NapbP28663 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NapbP28663 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NapbP28663 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NapbP28663 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NapbP28663 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NapbP28663 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NapbP28663 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NapbP28663 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NapbP28663 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NapbP28663 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NapbP28663 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NapbP28663 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NapbP28663 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NapbP28663 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NapbP28663 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NapbP28663 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NapbP28663 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NapbP28663 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NapbP28663 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NapbP28663 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NapbP28663 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NapbP28663 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NapbP28663 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NapbP28663 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NapbP28663 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NapbP28663 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NapbP28663 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NapbP28663 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NapbP28663 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NapbP28663 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NapbP28663 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NapbP28663 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NapbP28663 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NapbP28663 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NapbP28663 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NapbP28663 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NapbP28663 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NapbP28663 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NapbP28663 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NapbP28663 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NapbP28663 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NapbP28663 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NapbP28663 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NapbP28663 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NapbP28663 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NapbP28663 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NapbP28663 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NapbP28663 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NapbP28663 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms