Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Vpreb1P13372 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Vpreb1P13372 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Vpreb1P13372 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms