Protein–RNA interactions for Protein: P01811

Ig heavy chain V region UPC10, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01811 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01811 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01811 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01811 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01811 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01811 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01811 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01811 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01811 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01811 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01811 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01811 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01811 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01811 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01811 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01811 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01811 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01811 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01811 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01811 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01811 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01811 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01811 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01811 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01811 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01811 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01811 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01811 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01811 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01811 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01811 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01811 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01811 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01811 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01811 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01811 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01811 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01811 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01811 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01811 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01811 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01811 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01811 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01811 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01811 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01811 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01811 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01811 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01811 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01811 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01811 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01811 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01811 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01811 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01811 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01811 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01811 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01811 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01811 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01811 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01811 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01811 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01811 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01811 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01811 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01811 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01811 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01811 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01811 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01811 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01811 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01811 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01811 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01811 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01811 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01811 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01811 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01811 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01811 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01811 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01811 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01811 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01811 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01811 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01811 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01811 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01811 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01811 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01811 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01811 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01811 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01811 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01811 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01811 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01811 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01811 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01811 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01811 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01811 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01811 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms