Protein–RNA interactions for Protein: P01793

Ig heavy chain V region HPCG13, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01793 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01793 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01793 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01793 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01793 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01793 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01793 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01793 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01793 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01793 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01793 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01793 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01793 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01793 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01793 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01793 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01793 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P01793 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01793 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01793 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P01793 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01793 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01793 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01793 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01793 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01793 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01793 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01793 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01793 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01793 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01793 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01793 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01793 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01793 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01793 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01793 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01793 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01793 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01793 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01793 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01793 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01793 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01793 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01793 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01793 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01793 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01793 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01793 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01793 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01793 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01793 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01793 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01793 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01793 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01793 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01793 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01793 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01793 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01793 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01793 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01793 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01793 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01793 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01793 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01793 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01793 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01793 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01793 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01793 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01793 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01793 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01793 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01793 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01793 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01793 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01793 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01793 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01793 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01793 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01793 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01793 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01793 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01793 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01793 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01793 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01793 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01793 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01793 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01793 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01793 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01793 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01793 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01793 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01793 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01793 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01793 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
P01793 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01793 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01793 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01793 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms