Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vamp4O70480 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vamp4O70480 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vamp4O70480 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vamp4O70480 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Vamp4O70480 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vamp4O70480 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vamp4O70480 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vamp4O70480 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vamp4O70480 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vamp4O70480 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Vamp4O70480 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Vamp4O70480 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vamp4O70480 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Vamp4O70480 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vamp4O70480 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vamp4O70480 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Vamp4O70480 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vamp4O70480 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vamp4O70480 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vamp4O70480 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vamp4O70480 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Vamp4O70480 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Vamp4O70480 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Vamp4O70480 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vamp4O70480 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vamp4O70480 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vamp4O70480 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Vamp4O70480 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vamp4O70480 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vamp4O70480 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vamp4O70480 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Vamp4O70480 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vamp4O70480 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Vamp4O70480 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Vamp4O70480 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Vamp4O70480 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Vamp4O70480 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Vamp4O70480 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Vamp4O70480 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Vamp4O70480 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Vamp4O70480 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Vamp4O70480 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Vamp4O70480 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Vamp4O70480 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vamp4O70480 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vamp4O70480 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vamp4O70480 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Vamp4O70480 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Vamp4O70480 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vamp4O70480 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Vamp4O70480 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Vamp4O70480 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Vamp4O70480 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Vamp4O70480 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Vamp4O70480 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Vamp4O70480 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vamp4O70480 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vamp4O70480 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Vamp4O70480 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vamp4O70480 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vamp4O70480 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vamp4O70480 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vamp4O70480 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vamp4O70480 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vamp4O70480 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vamp4O70480 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vamp4O70480 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vamp4O70480 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vamp4O70480 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vamp4O70480 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vamp4O70480 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vamp4O70480 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vamp4O70480 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vamp4O70480 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vamp4O70480 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vamp4O70480 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vamp4O70480 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vamp4O70480 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vamp4O70480 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vamp4O70480 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vamp4O70480 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vamp4O70480 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vamp4O70480 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vamp4O70480 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vamp4O70480 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vamp4O70480 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vamp4O70480 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vamp4O70480 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vamp4O70480 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vamp4O70480 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Vamp4O70480 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Vamp4O70480 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Vamp4O70480 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Vamp4O70480 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vamp4O70480 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vamp4O70480 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vamp4O70480 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vamp4O70480 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vamp4O70480 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms