Protein–RNA interactions for Protein: O70404

Vamp8, Vesicle-associated membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp8O70404 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp8O70404 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vamp8O70404 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp8O70404 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms