Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pja1O55176 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pja1O55176 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pja1O55176 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pja1O55176 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pja1O55176 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pja1O55176 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pja1O55176 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pja1O55176 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pja1O55176 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pja1O55176 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pja1O55176 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pja1O55176 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pja1O55176 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pja1O55176 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pja1O55176 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pja1O55176 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pja1O55176 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pja1O55176 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pja1O55176 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pja1O55176 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pja1O55176 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pja1O55176 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pja1O55176 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pja1O55176 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pja1O55176 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pja1O55176 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pja1O55176 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pja1O55176 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pja1O55176 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pja1O55176 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pja1O55176 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pja1O55176 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pja1O55176 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pja1O55176 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pja1O55176 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pja1O55176 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pja1O55176 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pja1O55176 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pja1O55176 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pja1O55176 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pja1O55176 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pja1O55176 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pja1O55176 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pja1O55176 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pja1O55176 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pja1O55176 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pja1O55176 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pja1O55176 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pja1O55176 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pja1O55176 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pja1O55176 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pja1O55176 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pja1O55176 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pja1O55176 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pja1O55176 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pja1O55176 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pja1O55176 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pja1O55176 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pja1O55176 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pja1O55176 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pja1O55176 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms