Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2f6O54917 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E2f6O54917 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
E2f6O54917 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
E2f6O54917 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
E2f6O54917 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2f6O54917 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2f6O54917 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2f6O54917 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2f6O54917 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2f6O54917 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E2f6O54917 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2f6O54917 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2f6O54917 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2f6O54917 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2f6O54917 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
E2f6O54917 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2f6O54917 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
E2f6O54917 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2f6O54917 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
E2f6O54917 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2f6O54917 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2f6O54917 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2f6O54917 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2f6O54917 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
E2f6O54917 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2f6O54917 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
E2f6O54917 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2f6O54917 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
E2f6O54917 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2f6O54917 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2f6O54917 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2f6O54917 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
E2f6O54917 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2f6O54917 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2f6O54917 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
E2f6O54917 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
E2f6O54917 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
E2f6O54917 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E2f6O54917 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2f6O54917 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E2f6O54917 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
E2f6O54917 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
E2f6O54917 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
E2f6O54917 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2f6O54917 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2f6O54917 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2f6O54917 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2f6O54917 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2f6O54917 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2f6O54917 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2f6O54917 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
E2f6O54917 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2f6O54917 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2f6O54917 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2f6O54917 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E2f6O54917 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2f6O54917 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2f6O54917 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E2f6O54917 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2f6O54917 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E2f6O54917 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2f6O54917 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2f6O54917 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2f6O54917 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2f6O54917 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E2f6O54917 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2f6O54917 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2f6O54917 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2f6O54917 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2f6O54917 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2f6O54917 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E2f6O54917 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms