Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema6aO35464 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema6aO35464 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema6aO35464 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema6aO35464 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema6aO35464 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema6aO35464 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema6aO35464 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema6aO35464 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema6aO35464 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema6aO35464 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema6aO35464 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema6aO35464 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema6aO35464 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema6aO35464 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema6aO35464 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema6aO35464 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sema6aO35464 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sema6aO35464 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sema6aO35464 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sema6aO35464 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sema6aO35464 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sema6aO35464 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sema6aO35464 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema6aO35464 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema6aO35464 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema6aO35464 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema6aO35464 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema6aO35464 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sema6aO35464 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sema6aO35464 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms