Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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H2-Q1O19441 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-Q1O19441 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-Q1O19441 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-Q1O19441 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-Q1O19441 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-Q1O19441 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-Q1O19441 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-Q1O19441 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-Q1O19441 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
H2-Q1O19441 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
H2-Q1O19441 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
H2-Q1O19441 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
H2-Q1O19441 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
H2-Q1O19441 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
H2-Q1O19441 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
H2-Q1O19441 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
H2-Q1O19441 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
H2-Q1O19441 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
H2-Q1O19441 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
H2-Q1O19441 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-Q1O19441 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-Q1O19441 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-Q1O19441 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-Q1O19441 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-Q1O19441 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
H2-Q1O19441 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-Q1O19441 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-Q1O19441 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-Q1O19441 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-Q1O19441 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-Q1O19441 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-Q1O19441 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-Q1O19441 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
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H2-Q1O19441 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
H2-Q1O19441 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-Q1O19441 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-Q1O19441 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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H2-Q1O19441 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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H2-Q1O19441 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-Q1O19441 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
H2-Q1O19441 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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H2-Q1O19441 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-Q1O19441 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-Q1O19441 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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H2-Q1O19441 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
H2-Q1O19441 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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H2-Q1O19441 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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H2-Q1O19441 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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H2-Q1O19441 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
H2-Q1O19441 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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H2-Q1O19441 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
H2-Q1O19441 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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