Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm21310J3QQ23 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21310J3QQ23 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21310J3QQ23 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21310J3QQ23 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21310J3QQ23 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21310J3QQ23 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm21310J3QQ23 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21310J3QQ23 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21310J3QQ23 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21310J3QQ23 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21310J3QQ23 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21310J3QQ23 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm21310J3QQ23 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21310J3QQ23 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21310J3QQ23 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21310J3QQ23 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21310J3QQ23 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm21310J3QQ23 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21310J3QQ23 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21310J3QQ23 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21310J3QQ23 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21310J3QQ23 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21310J3QQ23 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21310J3QQ23 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21310J3QQ23 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21310J3QQ23 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21310J3QQ23 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm21310J3QQ23 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21310J3QQ23 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21310J3QQ23 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21310J3QQ23 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21310J3QQ23 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21310J3QQ23 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm21310J3QQ23 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21310J3QQ23 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21310J3QQ23 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21310J3QQ23 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21310J3QQ23 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21310J3QQ23 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21310J3QQ23 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21310J3QQ23 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm21310J3QQ23 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21310J3QQ23 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21310J3QQ23 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21310J3QQ23 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21310J3QQ23 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21310J3QQ23 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21310J3QQ23 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21310J3QQ23 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm21310J3QQ23 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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