Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Gm20795J3QP49 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20795J3QP49 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20795J3QP49 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20795J3QP49 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20795J3QP49 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Gm20795J3QP49 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20795J3QP49 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20795J3QP49 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20795J3QP49 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Gm20795J3QP49 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20795J3QP49 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20795J3QP49 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20795J3QP49 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20795J3QP49 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20795J3QP49 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20795J3QP49 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20795J3QP49 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20795J3QP49 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm20795J3QP49 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Gm20795J3QP49 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Gm20795J3QP49 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Gm20795J3QP49 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Gm20795J3QP49 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm20795J3QP49 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Gm20795J3QP49 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm20795J3QP49 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20795J3QP49 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20795J3QP49 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm20795J3QP49 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Gm20795J3QP49 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Gm20795J3QP49 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20795J3QP49 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20795J3QP49 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20795J3QP49 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20795J3QP49 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm20795J3QP49 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Gm20795J3QP49 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20795J3QP49 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm20795J3QP49 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20795J3QP49 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20795J3QP49 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20795J3QP49 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm20795J3QP49 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm20795J3QP49 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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