Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Raph1F2Z3U3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Raph1F2Z3U3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Raph1F2Z3U3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Raph1F2Z3U3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Raph1F2Z3U3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Raph1F2Z3U3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Raph1F2Z3U3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Raph1F2Z3U3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Raph1F2Z3U3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Raph1F2Z3U3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Raph1F2Z3U3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Raph1F2Z3U3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Raph1F2Z3U3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Raph1F2Z3U3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Raph1F2Z3U3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Raph1F2Z3U3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Raph1F2Z3U3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Raph1F2Z3U3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Raph1F2Z3U3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Raph1F2Z3U3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Raph1F2Z3U3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Raph1F2Z3U3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Raph1F2Z3U3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Raph1F2Z3U3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms