Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3298E9PW80 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3298E9PW80 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms