Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc13D3YV10 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc13D3YV10 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc13D3YV10 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc13D3YV10 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc13D3YV10 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc13D3YV10 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc13D3YV10 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc13D3YV10 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc13D3YV10 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc13D3YV10 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc13D3YV10 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc13D3YV10 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc13D3YV10 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc13D3YV10 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc13D3YV10 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc13D3YV10 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc13D3YV10 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc13D3YV10 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc13D3YV10 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc13D3YV10 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc13D3YV10 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc13D3YV10 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc13D3YV10 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc13D3YV10 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc13D3YV10 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc13D3YV10 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc13D3YV10 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc13D3YV10 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc13D3YV10 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc13D3YV10 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms