Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hbb-bh2B2RVB7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hbb-bh2B2RVB7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hbb-bh2B2RVB7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms