Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Skint2A7XUX6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Skint2A7XUX6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Skint2A7XUX6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms