Protein–RNA interactions for Protein: A2AUQ8

4930402F06Rik, MCG21268, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930402F06RikA2AUQ8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930402F06RikA2AUQ8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4930402F06RikA2AUQ8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930402F06RikA2AUQ8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930402F06RikA2AUQ8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930402F06RikA2AUQ8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930402F06RikA2AUQ8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930402F06RikA2AUQ8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930402F06RikA2AUQ8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930402F06RikA2AUQ8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930402F06RikA2AUQ8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930402F06RikA2AUQ8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
4930402F06RikA2AUQ8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930402F06RikA2AUQ8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930402F06RikA2AUQ8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930402F06RikA2AUQ8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930402F06RikA2AUQ8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930402F06RikA2AUQ8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4930402F06RikA2AUQ8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930402F06RikA2AUQ8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930402F06RikA2AUQ8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930402F06RikA2AUQ8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930402F06RikA2AUQ8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930402F06RikA2AUQ8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930402F06RikA2AUQ8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930402F06RikA2AUQ8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930402F06RikA2AUQ8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930402F06RikA2AUQ8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930402F06RikA2AUQ8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930402F06RikA2AUQ8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930402F06RikA2AUQ8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930402F06RikA2AUQ8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930402F06RikA2AUQ8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930402F06RikA2AUQ8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930402F06RikA2AUQ8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930402F06RikA2AUQ8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930402F06RikA2AUQ8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930402F06RikA2AUQ8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930402F06RikA2AUQ8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930402F06RikA2AUQ8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930402F06RikA2AUQ8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930402F06RikA2AUQ8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930402F06RikA2AUQ8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930402F06RikA2AUQ8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930402F06RikA2AUQ8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930402F06RikA2AUQ8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930402F06RikA2AUQ8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930402F06RikA2AUQ8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930402F06RikA2AUQ8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930402F06RikA2AUQ8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms