Protein–RNA interactions for Protein: A2AQH1

Cerkl, Ceramide kinase-like, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CerklA2AQH1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CerklA2AQH1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CerklA2AQH1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CerklA2AQH1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CerklA2AQH1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CerklA2AQH1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CerklA2AQH1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CerklA2AQH1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CerklA2AQH1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CerklA2AQH1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CerklA2AQH1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CerklA2AQH1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CerklA2AQH1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CerklA2AQH1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CerklA2AQH1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CerklA2AQH1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CerklA2AQH1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CerklA2AQH1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CerklA2AQH1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CerklA2AQH1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CerklA2AQH1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CerklA2AQH1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CerklA2AQH1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CerklA2AQH1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CerklA2AQH1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CerklA2AQH1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CerklA2AQH1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CerklA2AQH1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CerklA2AQH1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CerklA2AQH1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CerklA2AQH1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CerklA2AQH1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CerklA2AQH1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CerklA2AQH1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CerklA2AQH1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CerklA2AQH1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CerklA2AQH1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CerklA2AQH1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CerklA2AQH1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CerklA2AQH1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CerklA2AQH1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CerklA2AQH1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CerklA2AQH1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CerklA2AQH1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CerklA2AQH1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CerklA2AQH1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CerklA2AQH1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CerklA2AQH1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CerklA2AQH1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CerklA2AQH1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CerklA2AQH1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CerklA2AQH1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms