Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Syndig1A2ANU3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syndig1A2ANU3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syndig1A2ANU3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syndig1A2ANU3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syndig1A2ANU3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Syndig1A2ANU3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syndig1A2ANU3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syndig1A2ANU3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syndig1A2ANU3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syndig1A2ANU3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syndig1A2ANU3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syndig1A2ANU3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Syndig1A2ANU3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syndig1A2ANU3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syndig1A2ANU3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syndig1A2ANU3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syndig1A2ANU3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syndig1A2ANU3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Syndig1A2ANU3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syndig1A2ANU3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syndig1A2ANU3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syndig1A2ANU3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Syndig1A2ANU3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syndig1A2ANU3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Syndig1A2ANU3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syndig1A2ANU3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syndig1A2ANU3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syndig1A2ANU3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syndig1A2ANU3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syndig1A2ANU3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syndig1A2ANU3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Syndig1A2ANU3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Syndig1A2ANU3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Syndig1A2ANU3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Syndig1A2ANU3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syndig1A2ANU3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syndig1A2ANU3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms