Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GRE8

Zscan4e, Zinc finger and SCAN domain-containing 4E, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4eA0A1B0GRE8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zscan4eA0A1B0GRE8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zscan4eA0A1B0GRE8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zscan4eA0A1B0GRE8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zscan4eA0A1B0GRE8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zscan4eA0A1B0GRE8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zscan4eA0A1B0GRE8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zscan4eA0A1B0GRE8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zscan4eA0A1B0GRE8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zscan4eA0A1B0GRE8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Zscan4eA0A1B0GRE8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Zscan4eA0A1B0GRE8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zscan4eA0A1B0GRE8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zscan4eA0A1B0GRE8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zscan4eA0A1B0GRE8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zscan4eA0A1B0GRE8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zscan4eA0A1B0GRE8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zscan4eA0A1B0GRE8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zscan4eA0A1B0GRE8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zscan4eA0A1B0GRE8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zscan4eA0A1B0GRE8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zscan4eA0A1B0GRE8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zscan4eA0A1B0GRE8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zscan4eA0A1B0GRE8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zscan4eA0A1B0GRE8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zscan4eA0A1B0GRE8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zscan4eA0A1B0GRE8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zscan4eA0A1B0GRE8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zscan4eA0A1B0GRE8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zscan4eA0A1B0GRE8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zscan4eA0A1B0GRE8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zscan4eA0A1B0GRE8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zscan4eA0A1B0GRE8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zscan4eA0A1B0GRE8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zscan4eA0A1B0GRE8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zscan4eA0A1B0GRE8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zscan4eA0A1B0GRE8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zscan4eA0A1B0GRE8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zscan4eA0A1B0GRE8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zscan4eA0A1B0GRE8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zscan4eA0A1B0GRE8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zscan4eA0A1B0GRE8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Zscan4eA0A1B0GRE8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zscan4eA0A1B0GRE8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zscan4eA0A1B0GRE8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zscan4eA0A1B0GRE8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Zscan4eA0A1B0GRE8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms