Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccne2Q9Z238 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccne2Q9Z238 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccne2Q9Z238 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccne2Q9Z238 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccne2Q9Z238 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccne2Q9Z238 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccne2Q9Z238 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccne2Q9Z238 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccne2Q9Z238 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccne2Q9Z238 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccne2Q9Z238 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccne2Q9Z238 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccne2Q9Z238 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccne2Q9Z238 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccne2Q9Z238 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccne2Q9Z238 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccne2Q9Z238 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccne2Q9Z238 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccne2Q9Z238 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccne2Q9Z238 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccne2Q9Z238 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccne2Q9Z238 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccne2Q9Z238 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccne2Q9Z238 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccne2Q9Z238 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccne2Q9Z238 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccne2Q9Z238 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccne2Q9Z238 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ccne2Q9Z238 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ccne2Q9Z238 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccne2Q9Z238 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccne2Q9Z238 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccne2Q9Z238 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccne2Q9Z238 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccne2Q9Z238 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccne2Q9Z238 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccne2Q9Z238 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccne2Q9Z238 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccne2Q9Z238 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccne2Q9Z238 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccne2Q9Z238 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccne2Q9Z238 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccne2Q9Z238 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccne2Q9Z238 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccne2Q9Z238 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccne2Q9Z238 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccne2Q9Z238 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccne2Q9Z238 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccne2Q9Z238 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccne2Q9Z238 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccne2Q9Z238 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccne2Q9Z238 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccne2Q9Z238 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccne2Q9Z238 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccne2Q9Z238 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccne2Q9Z238 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccne2Q9Z238 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccne2Q9Z238 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccne2Q9Z238 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccne2Q9Z238 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccne2Q9Z238 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccne2Q9Z238 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccne2Q9Z238 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccne2Q9Z238 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccne2Q9Z238 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccne2Q9Z238 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccne2Q9Z238 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccne2Q9Z238 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccne2Q9Z238 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccne2Q9Z238 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccne2Q9Z238 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccne2Q9Z238 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccne2Q9Z238 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccne2Q9Z238 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccne2Q9Z238 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccne2Q9Z238 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccne2Q9Z238 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccne2Q9Z238 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccne2Q9Z238 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccne2Q9Z238 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccne2Q9Z238 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccne2Q9Z238 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccne2Q9Z238 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccne2Q9Z238 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccne2Q9Z238 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccne2Q9Z238 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccne2Q9Z238 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccne2Q9Z238 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccne2Q9Z238 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccne2Q9Z238 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccne2Q9Z238 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccne2Q9Z238 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccne2Q9Z238 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccne2Q9Z238 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccne2Q9Z238 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccne2Q9Z238 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccne2Q9Z238 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccne2Q9Z238 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccne2Q9Z238 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms