Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV18

Gabbr1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabbr1Q9WV18 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gabbr1Q9WV18 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gabbr1Q9WV18 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gabbr1Q9WV18 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gabbr1Q9WV18 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gabbr1Q9WV18 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gabbr1Q9WV18 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gabbr1Q9WV18 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gabbr1Q9WV18 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gabbr1Q9WV18 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gabbr1Q9WV18 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gabbr1Q9WV18 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gabbr1Q9WV18 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gabbr1Q9WV18 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gabbr1Q9WV18 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gabbr1Q9WV18 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gabbr1Q9WV18 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gabbr1Q9WV18 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gabbr1Q9WV18 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gabbr1Q9WV18 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gabbr1Q9WV18 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gabbr1Q9WV18 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Gabbr1Q9WV18 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gabbr1Q9WV18 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gabbr1Q9WV18 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gabbr1Q9WV18 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gabbr1Q9WV18 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gabbr1Q9WV18 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gabbr1Q9WV18 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gabbr1Q9WV18 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gabbr1Q9WV18 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gabbr1Q9WV18 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gabbr1Q9WV18 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gabbr1Q9WV18 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gabbr1Q9WV18 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gabbr1Q9WV18 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gabbr1Q9WV18 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gabbr1Q9WV18 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gabbr1Q9WV18 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gabbr1Q9WV18 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gabbr1Q9WV18 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gabbr1Q9WV18 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gabbr1Q9WV18 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gabbr1Q9WV18 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gabbr1Q9WV18 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gabbr1Q9WV18 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gabbr1Q9WV18 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gabbr1Q9WV18 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gabbr1Q9WV18 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gabbr1Q9WV18 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gabbr1Q9WV18 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gabbr1Q9WV18 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gabbr1Q9WV18 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gabbr1Q9WV18 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gabbr1Q9WV18 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gabbr1Q9WV18 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gabbr1Q9WV18 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gabbr1Q9WV18 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gabbr1Q9WV18 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gabbr1Q9WV18 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gabbr1Q9WV18 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms