Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdc42ep4Q9JM96 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdc42ep4Q9JM96 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdc42ep4Q9JM96 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdc42ep4Q9JM96 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdc42ep4Q9JM96 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdc42ep4Q9JM96 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdc42ep4Q9JM96 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdc42ep4Q9JM96 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdc42ep4Q9JM96 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdc42ep4Q9JM96 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdc42ep4Q9JM96 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdc42ep4Q9JM96 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdc42ep4Q9JM96 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdc42ep4Q9JM96 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdc42ep4Q9JM96 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdc42ep4Q9JM96 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdc42ep4Q9JM96 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdc42ep4Q9JM96 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdc42ep4Q9JM96 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdc42ep4Q9JM96 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms