Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccl28Q9JIL2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccl28Q9JIL2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl28Q9JIL2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl28Q9JIL2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl28Q9JIL2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl28Q9JIL2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccl28Q9JIL2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms