Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn19Q9ET38 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cldn19Q9ET38 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cldn19Q9ET38 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn19Q9ET38 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn19Q9ET38 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn19Q9ET38 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn19Q9ET38 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn19Q9ET38 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn19Q9ET38 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn19Q9ET38 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn19Q9ET38 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn19Q9ET38 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn19Q9ET38 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn19Q9ET38 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn19Q9ET38 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn19Q9ET38 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn19Q9ET38 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn19Q9ET38 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn19Q9ET38 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn19Q9ET38 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn19Q9ET38 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn19Q9ET38 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn19Q9ET38 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn19Q9ET38 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn19Q9ET38 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn19Q9ET38 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn19Q9ET38 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn19Q9ET38 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn19Q9ET38 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn19Q9ET38 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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